Во-первых, дело в терминологии. Одно и то же понятие может трактоваться в разных ведомствах по-разному. Во-вторых, важную роль играет методология сбора и анализа данных. Например, в одном случае данные могут иметь сезонную корректировку, в другом - нет, или статистика может собираться по определенной категории, например, возрастной.
Нельзя сказать, что какое-то ведомство собирает или обрабатывает информацию лучше другого. Чтобы дать точный ответ на вопрос, нужно понимать, какой именно показатель имеется в виду и, в целом, следует внимательно изучить методику расчета, а также информацию о конечном представлении данных.
Ну, во-первых ГИБДД составная часть МВД и у них не может быть разная статистика. Во-вторых у каждого ведомства свои критерии оценки положительной динамики, которые различаются, отсюда и разные итоговые данные.