Потому что история Адама и Евы вымышленная, оттуда и несогласованность с реальностью. Даже если представить, что она в действительности происходила, все текущие изображения рисовались не с натуры и являются фантазией художника, который, в свою очередь, не задумывался над тем, над чем задумались вы.
Возможно пупки всё таки были для дальнейшего генетического моделирования потомков
Это же фантазия художника. Насколько мне известно, ни в каком из святых писаний авраамических религий нет рисунков с изображением Адама и Евы. "Я художник, я так вижу".