С биологической точки зрения причина кроется в помеси защитной реакции организма и перевозбуждения его нервной системы, более точно зависит от ситуации, в случае сильной боли - это врождённая реакция организма, которая позитивным бонусом позволяет перераспределить нервное возбуждение более равномерно и задействовав древние части нервной системы(в частности врождённые), в целом организм много таких "трюков" проделывает, вернее как - делает он это не умышленно, он просто так устроен, что избыточный "ток" пробивает пороги и возбуждает другие отделы, с часто более крепкой частью НС, помимо слёз к таким побочным эффектам перераспределения относятся рефлекторное сжатие рук, зубов и многое другое. Другими словами эмоции вас перевозбуждают, а организм, чтобы недопустить травм может перераспределить возбуждение с повышения давления, сердцебиения, на нервную систему, которая в свою очередь при достаточной силе возбудит всю подсистему организма связанную со слёзотечением.
В целом с эмоциями нужно быть осторожнее, т.к. эмоции меняют поведение организма и не всегда ему на пользу, например отрицательные эмоции, могут перерождаться в стресс и в широкий спектр мобилизационных мероприятий организма, который полезен только в случае возникновения опасности, но в общем случае напротив расходует силы и истощает организм. С положительным эмоциями лучше, но долгие сильные положительные(как и любые долгие и сильные) эмоции это также могут быть вредны, в виду гормональных перепадов и влияния некоторых гормонов на внимание, разумность, самокритичность и т.д., например длительный смех может породить сильное снижение порога к смеху и способность его сдерживания(у меня в ответах был личный пример по этому поводу). Поэтому лучше спокойнее относиться к эмоциям, в особенности не допускать длительных и сильных, т.к. они нагружают организм и могут вам навредить, другими словами - как и всему в этом мире эмоций нужно в меру.