Стоит ли использовать Cython для ускорения кода Python?

Обратите внимание, что на официальном же сайте Cython говорится, что pybench показывает лишь 30%-й прирост производительности. Оно и понятно, если результирующий код линкуется с пайтоновской библиотекой и использует те же структуры и алгоритмы. Это по сути замена интерпретации скриптового кода обычной предварительной (не JIT) компиляцией. Это даёт ускорение структурного императивного кода (циклы, ветвления и т.п.). Традиционный подход в оптимизации кода на Python — свести к минимуму структурный подход, заменив, например, циклы на map (функциональная парадигма), т.е. используя заранее оптимизированные и скомпилированные функции языка. Также стоит избавиться от глобальных переменных, которые из-за GIL радикально снижают производительность.