Нормально :)
Это довольно распространенное явление, которое сохранилось с древних времен, когда ночь являлась самым опасным временем для человека: на него могли напасть дикие животные, соседние племена и т.д. На генетическом уровне современный человек продолжает чувствовать тревогу и беспокойство в это время суток.
Также пугает и сама темнота за окном: вы плохо видите, что там, поэтому не можете контролировать ситуацию. Особенно это заметно у детей. У многих страх темноты и ночи в детстве с взрослением трансформируется в легкое чувство дискомфорта.
Еще, может быть, что вам неприятно само чувство завершения дня. Нас внутренне пугает конец чего-либо: дня, жизни, света, так как за концом лежит неизвестность. А ночь и темнота, к тому же часто ассоциируется со смертью. Конечно, мы вряд ли будет отчетливо осознавать это. Но все-таки в совокупности все эти причины могут создать то неприятное ощущение, о котором вы говорите.