Вообще то основное значение термина "пенетрация" - измерение структурно-механических характеристик полутвёрдых и твёрдых тел путём определения сопротивления проникновению в них за определенное время инденторов (конус, шар, игла, цилиндр) имеющих строго определённые размер, массу и материал.
В медицине обычно используется в значении распространение патологического процесса за пределы органа или части тела.