Здравствуйте, Дмитрий!
Можно ли самостоятельно выбрать систему налогообложения при открытии ИП
Да, можно. ИП может в течение 30 дней после регистрации выбрать подходящую систему налогообложения. Если не выберет, то он будет на общей системе налогообложения (ОСНО).
какое налогообложение самое выгодное?
Тут невозможно ответить без дополнительных данных. В любом случае придется считать, что выгоднее конкретно в вашем случае.