"Трупы" микробов - это кусочки белка и разрозненные микроэлементы. Деваться им особо некуда: либо оставаться в воде, либо выпариваться вместе с паром. Эти остатки не опасны - абсолютно чистой воды все равно не бывает, и даже если добиться такой чистоты многократной дистилляцией, вреда от такой воды будет больше чем пользы.