В общем-то зависело от обстоятельств. По большей части убивал, например, ближайший соратник его отца (и один ключевых командиров армии) Парменион был убит по подозрению в участии заговора против Александра, вместе с его сыном, который собственно его и организовал.
Непосредственно с побежденными царями вёл себя наоборот достаточно уважительно.
Разбив индийского царя Пора, Александр сохранил за ним существующие владения, присовокупив ещё и часть других.
Во время подавления восстаний в Бактрии и Согдиане, Александр прибегнул к тотальному террору, вырезая местное население в качестве акции устрашения. Диодор пишет о 120 000 убитых, вопрос доверия тут риторический, точный подсчёт очевидно никто не вёл, но десятки тысяч убитых вполне могли иметь место.
В целом, все зависело от обстоятельств - восставшие города или предатели убивались без особого сожаления. Сдавшие в плен или побежденные цари уважались. Например, Бесса, убийцу Дария, Александр казнил, потому что не по чину было убивать столь знатного человека.
Другой вопрос, что он был довольно импульсивным - например, по-пьяни убил ближайшего соратника Клита в ходе перепалки. Похоже, с алкоголем у них вообще проблемы были - пара воинов из таксиса Пердикки, напившись чуть было вдвоем Галикарнасс не захватили, а Александр с друзьями же как-то навеселе дворец в Персеполе сожгли.