Были ли межнациональные конфликты в СССР до 80-х годов?

Разумеется, были.

Есть знаменитая частушка:

Так что вся эта дружба народов была чисто на картинке.

Зачастую национальные конфликты были искусственно взращены преступной политикой государства. Про депортации народов в другом ответе уже упомянули. Позже, когда высланные народы стали возвращаться, они прибывали не на пустое место. Соответственно, был неизбежен конфликт между ними, и теми, кто заселился на их территории. Кульминацией можно считать беспорядки в городе Грозном в 1958 году.

После Второй мировой войны в рамках так называемой "борьбы с космополитизмом", фактически поощрялся сверху антисемитизм. Вторая волна была как следствие Шестидневной войны, когда крайними за позорное поражение арабских стран почему-то сделали собственных граждан еврейского происхождения. Никаких погромов не было, но фактически началось ущемление на основе "не той" национальности в "5-ой графе".

Грузино-абхазский конфликт объясняется во многом ползучей грузинизацией Абхазии, когда на все должности старались назначить грузин - об этом упомянуто, например, у писателя Ф.Искандера. В рамках этой же тенденции депортировали абхазских греков. Когда читаю или слышу вскукареки тех, кто смеет оправдывать депортации народов СССР тем, что якобы была какая-то "необходимость", мне очень интересно узнать: какую угрозу представляли греки в 1949 году? Советский Союз вёл войну с Грецией, и греческие войска могли оккупировать Абхазию?)

Бытовой расизм вполне себе процветал. В армии "учили чурок", причём это было даже в 1940-е гг, о чём можно найти свидетельства, например, в книге Энвера Алтайлы "Трудный путь к свободе. Рузи Назар: от Красной армии до ЦРУ".

В 1970-80-е в страну массово приезжали на заработки вьетнамцы - у них были конфликты с выходцами с Кавказа.

Насколько в реальности была "добрая" обстановка, можно найти ещё в произведении Ю.Даниэля "Говорит Москва" (1960-е гг.):

Там рассказывается о вымышленном событии, как если бы сверху разрешили открытые убийства, но тем не менее само это описание примечательно.

В части ВОХР целенаправленно старались набирать представителей нерусских народов, чтобы у них не было сочувствия к заключённым.

Так что все конфликты 1980-х были давно заложены, и до этого сдерживались штыками.