Добрый день!
Саму канаву отмечать не стоит, а обозначить то, что там есть вода можно. Вам надо добавить линейный объект из раздела Гидрография
После того как Вы отрисуете линию кювета, задайте ему условное название в поле Входит в состав, затем на Создать новую реку и затем Сохранить.
После сохранения нажмите на название
В открывшейся карточке нажмите на редактирование
В разделе Тип укажите мелиоративный канал, придуманное название удалите, теперь можно Сохранить
P.S. При отрисовке линии кювета не забывайте скруглять углы.