Удачная версия - это Винда индексацию делает. Теоретически - можно отключить индексацию, практически - будете ждать до посинения. И в любом случае это тревожный сигнал, либо HDD сам кончается, либо его старательно убивают.
Возможно, система его проверяет, дефрагментирует или ещё как-то оптимизирует - надо смотреть, какие службы запущены.
И самый простой вариант - HDD сканирует антивирус.