Уточните, именно налоговая затребовала возврат уже выплаченных средств и прислала для этого официальное Требование?
Или же в личном кабинете отражается сумма к уплате НДФЛ?
Для 1-го варианта нужны подробности ситуации.
Если Ваш вариант 2-й, то, возможно, это новый алгоритм ЛК, который после отправки корректирующей декларации "требует" вернуть НДФЛ, который был указан в предыдущей 3-НДФЛ.