Вы путаете понятия. Речь идет вовсе не о регистрации юрлица и внесении его в ЕГРЮЛ. ЦБ не регистрирует юрлица, разумеется. Он занимается выдачей лицензий, необходимых в силу закона финансовым организациям для ведения профессиональной деятельности. Вы можете зарегистрировать ООО "Фондовый центр Ромашка", но без лицензии ЦБ - это будет просто_какая-то_компания "Фондовый центр Ромашка". Словосочетание "фондовый центр" в названии не делает это ООО профессиональным участником рынка ценных бумаг. Точно так же вы можете открыть ООО "Банковский банк БАНКЪ", но без лицензии ЦБ эта компания не сможет легально вести деятельность кредитной организации.
Пассаж: "Проблема не в компаниях, а в том, кто их регистрирует" трудно комментировать, так как не очень понятно, что вы имеете в виду.