Будут. При перевыпуске меняется номер на карте, срок действия, код безопасности и ПИН. Но не меняется счёт, на который была открыта эта карта. Финансовые организации, списывают деньги со счетов, а не с карты. Вы так же снимаете деньги со счета с помощью пластика, только и всего. Так что, да, будут.