На кредитную историю влияют только факты своевременного погашения займов и наличие просрочки.
А вот на ваш кредитный рейтинг, скорее всего влияют и не в лучшую сторону.
Большинство крупных федеральных банков (Сбер, ВТБ, Альфа, Россельхоз и т.д.), в скоринговой оценке заемщика и присвоение кредитного рейтинга, ввели корректирующий коэффициент при наличии действующих займов в МФО. Данный коэффициент снижает кредитный рейтинг заемщика, либо является стоп фактором.