Фактически никак. На основной деятельности компании это никак отразится не должно.
Что должна сделать организация ставшая участником реестра ОРИ( организатор распространения информации):
Хранить на территории Российской Федерации в течение года информацию о фактах приема, передачи, доставки или обработки всех сообщений от пользователей (включая тексты, голосовые сообщения, видео и т.д.) и информацию об этих пользователях.
В течение шести месяцев хранить сами сообщения.
Предоставлять эту информацию государственным органам, которые осуществляют оперативно-разыскную деятельность.
Предоставлять ФСБ информацию для декодирования электронных сообщений, если на сайте используется дополнительное кодирование.
Разработать программу взаимодействия с ФСБ, назначить сотрудника, ответственного за это взаимодействие, и установить оборудование для обеспечения удаленного доступа ФСБ к информации о пользователях сайта и их действиях. Все это компания Qiwi уже делает и фактически участие в этом реестре для компании простая формальность.