Что делают собаки, когда хозяева уходят?

Преимущественно спят. 

Разумеется, если мы описываем ситуацию с нормальной собакой, не отягощённой неправильным воспитанием и имеющимися от этого проблемами, такими как разрушение входного пространства, уничтожение дивана и любых лежачих мест, уничтожение кухни и поиск всего съестного что можно найти в доме, уничтожение проводов, плинтусов и всего вкусного (с точки зрения собаки). Всё перечисленное — поведенческие отклонения, которых при нормальном воспитании быть не должно, и которые можно не допустить или купировать. 

Изначально (совсем изначально) собака является сумеречным охотником. То есть охотником, добывающем себе еду в сумерках. Именно этим объясняется активность щенков в вечернее время (часов так в десять вечера). В середине дня и в середине ночи собака в принципе и должна спать в природе. При этом собака, в отличии от человека, при достаточных нагрузках за сутки, очень много времени может спать, гораздо больше, чем человек.