Добрый день! Сразу скажу про катер - насколько мне известно, можно организовать индивидуальную речную прогулку, только это дороговато)))
Если все известные места Вы знаете, можете, сходить, например, посмотреть на дом Воланда из экранизации "Мастера и Маргариты", он находится по адресу Новгородская улица, 3, рядом с метро Площадь Восстания. Также очень советую просто пройтись по Большому проспекту Петроградской стороны - он небольшой, буквально 2 км, от метро Петроградская до метро Спортивная. Тёплым майским вечером там особая атмосфера. В Пулковскую обсерваторию обязательно сходите! Если ещё не были, замечательное место. "Гранд-макет Россия" посетите - на площадке около 800 м² объединены собирательные образы городов и регионов России. Китайский "сад дружбы" тоже интересное место, сад Сен-Жермен, Ботанический сад на Петроградке.
Просто погулять, помимо Большого проспекта, могу посоветовать Итальянскую улицу (на обратной стороне Невского проспекта), там у дома 29 интересный дворик есть с изображениями Рима.
И ещё - метрополитен. Обязательно сходите в метро, лучший музей. Посетите самую красивую станцию метро в мире - Автово, на Бухарестской в мозаике поищите "Птицу счастья" и обязательно загадайте желание, Адмиралтейская и Международная - просто красивые станции, на Волковской на панно рыжий кот - тоже если погладить его и загадать желание, говорят, сбудется:)
Хорошего отдыха!