Почему мы переживаем о вымирании видов, если, согласно теории эволюции, должны появляться новые виды? Или теория не работает?

В вопросе содержится несколько спорных тезисов, которые, в свою очередь порождают вопросы. По порядку. Когда говорят "мы", то имеют в виду либо всё человечество, либо узкую группу, озабоченную вымиранием видов. Важно именно то, как ведёт себя человечество, которое ради растущего потребления уничтожает среду обитания множества "диких" видов. Как ни странно, в стабильных условиях (когда происходит мало внешних по отношению к самой биоте нарушений) разнообразие видов, населяющих территорию уменьшается. Различные нарушения (наводнения, ураганы, пожары, эрозия почв) увеличивают число экологических ниш, которые заселяются видами, специально для них приспособленными и имеющими здесь конкурентное преимущество. Речь не идёт об увеличении генетического разнообразия на больших территориях, где многие виды вынужденно переживают недостаток экологических ниш в латентном, малочисленном состоянии, по какой причине их трудно выявить и учесть ( есть даже такое понятие - волны жизни - когда, вроде бы ни с того, ни с сего, в массе появляется вид дотоле числившийся крайне редким). "Теория эволюции" ни причём, она описывает естественную историю видов, констатируя тот факт, что одни виды могут порождать другие. Вымирание - факт экологический. Если экологическая ниша, занимаемая тем или иным видом стабильна на протяжении длительного времени, то и вид имеет все шансы просуществовать это время.