Какие процессы приводят к изменению частоты встречаемости генов в популяциях?

Первым и основным является естественный отбор, даже в тех популяциях, в которых он, казалось бы, не действует он есть. На равном первому месте находится генетический дрейф, он характерен для небольших полиморфных популяций. Конечным же критерием встречаемости гена будет его адаптогенный потенциал, если ген полезен для процесса адаптации в конкретных условиях, то и встречать мы его будем чаще. То же характерно для эволюционно нейтральных некодирующих последовательностей, они могут встречаться спорадически, а могут быть крайне распространены, как например бОльшая часть генома кукурузы.