Это база! Любое вещество, а это любой однородный материал, или жидкость, или газ, состоит из молекул. То есть молекула - это самая малая единица, составляющая любое вещество. Одна молекула - не вещество, много - вещество. Сама же молекула делится на атомы, атомы создают заряд молекулы и определяют свойства этой молекулы, а следовательно, и свойства образующегося вещества. Молекула может состоять из атомов разного рода, разнообразие атомов представлено в таблице Менделеева. Например, Cl- -это ион хлора, или атом хлора, имеющий отрицательный заряд, и поэтому точнее называющийся анионом. А Cl2 - это уже молекула хлорного газа. А сам газ совокупность множества таких молекул.
Клетка же это вообще из другой оперы, клетка - это единица всего живого, её конструкты это органеллы, выполняющие определённые функции, которые сами по себе состоят из различных молекул белков, фосфолипидов, полисахаридов и т.д.
Ну и по официальным терминам:
Атом - мельчайшая частица химического элемента, состоящая из ядра и электронов.
Молекула - мельчайшая частица вещества, имеющая все его основные химические свойства.
Клетка - структурно-функциональная элементарная единица строения и жизнедеятельности всех организмов.