"Слава Богу" — исходно выражение признательности Богу за предоставленное благо. Сейчас эта фраза просто отмечает, что что-то идёт хорошо.
"Слава России" — в современной реальности это идиотская калька с лозунга украинского Правого Сектора — "Слава Украине!". Мол, не Украину нужно славить, а Россию. Произносить это — всё равно что произносить "хайль Путин", поднимая руку от сердца к солнцу.
Так что, вместо "слава Богу" лучше сказать "отлично" или "превосходно". Вместо "ну и слава Богу" — "вот и хорошо". Вместо "слава Богу ты вернулся" — "наконец-то ты вернулся" и т. д.
А вообще, я как атеист, не вижу смысла намеренно бороться с культурным кодом. Даже если он связан с религией. Если привыкли говорить "слава Богу!" — то незачем искать альтернативы. Вы и ваш собеседник, вероятно, понимаете, что это просто фигура речи.