А Вам не приходило в голову, что Вера - в первую очередь, "личное" качество?
Дальше - всё просто. Атеист читает некий текст, и искренне не понимает - как в "это" вообще можно верить? Сперва пытается переубедить "верующего" с помощью "науки", потом, "скрипя зубами", изучает не только этот текст, но и те, что с ним связаны, и старательно демонстрирует "верующему" все ошибки и противоречия, имеющиеся в данной религии..
И, столкнувшись с очередным "провалом", начинает искать объяснение данного "феномена" в личности "верующего".