Лучше и проще всего сначала пропустить воду через песок, уголь и ткань, а потом провести её дистилляцию - перегонку, причём перегонять недосуха. Так вода будет гарантированно очищена от органических и неорганияеских загрязнителей. Она при этом будет близка к дистиллированной: пить такую воду длительное время вредно, но для выживания подойдёт. Также можно конденсировать пары и росу из воздуха с помощью полимерной плёнки или стекла.
Продаются ультрафиолетовые обеззараживатели, но их эффективность сомнительна. И - опять же - фильтровать придётся.