Правда ли, что используемый сейчас ПЦР-тест на SARS-CoV-2 не способен отличить коронавирус от гриппа?

Это неправда. Разделим ответ на несколько частей.

Верно ли он интерпретирует слова CDC?

Нет, неверно. Ещё раз приведем цитату.

В рамках подготовки к этому изменению CDC рекомендует клиническим лабораториям и испытательным площадкам, которые использовали анализ CDC 2019-nCoV RT-PCR, выбрать и начать переход к другому разрешенному FDA тесту COVID-19. CDC рекомендует лабораториям рассмотреть вопрос о внедрении мультиплексного метода, который может облегчить обнаружение и дифференцирование вирусов SARS-CoV-2 и гриппа.

Что такое мультиплексная ПЦР? Это метод, при котором одновременно в одной пробирке осуществляется обнаружение нескольких мишеней. В данном случае CDC рекомендует перейти на одновременное обнаружение SARS-CoV-2 и гриппа. Почему CDC это рекомендует?

Такие анализы могут облегчить дальнейшее тестирование как на грипп, так и на SARS-CoV-2 и могут сэкономить как время, так и ресурсы, поскольку мы вступаем в сезон гриппа.

Следует ли из этих слов то, что "используемый ПЦР тест на сарс-Ков-2 НЕ СПОСОБЕН отличить коронавирус от гриппа"? Нет, не следует. То есть, уже на основании этого заявление является фейком.

Непредвзято ли он интерпретирует слова CDC?

Нет, увы. Это следует из заявления "Якова" далее:

А если ещё учесть, что нет ни коронавируса ни вируса гриппа, то масштаб обмана смогут оценить "не только лишь все, мало кто может это сделать!"(с)

Таким образом, автор данного фейка является сторонником гипотезы о том, что вирусов не существует. Но при этом он ищет подтверждения своим словам в заявлениях CDC, организации, которая порекомендовала перейти от тестирования только на SARS-CoV-2 к одновременному тестированию на SARS-CoV-2 и грипп. Хотя казалось бы, в этом случае все их слова должны были бы быть неправдой! Это, на мой взгляд, является прекрасным проявлением феномена селективного восприятия.

Могут ли на самом деле тесты на SARS-CoV-2 не отличать его от гриппа?

Для того, чтобы ответить на данный вопрос, требуется разобраться в принципе работы полимеразной цепной реакции (ПЦР).

Данный метод основан на многократном размножении определенного участка ДНК в пробе и последующим обнаружением размноженной (амплифицированной) ДНК. В данном случае, так как у коронавирусов нет ДНК, для этого она сначала синтезируется по матрице вирусной РНК с помощью фермента обратной транскриптазы.

Каким образом метод ПЦР "определяет", что в пробе есть нужный участок ДНК, который будет подвергаться размножению? Для этого в реакционной смеси содержатся праймеры - короткие одноцепочечные молекулы ДНК, которые должны быть комплементарны концам размножаемого фрагмента. Длина праймеров должна быть порядка 20 нуклеотидов, из которых для протекания реакции обычно 18-19 должны совпадать с обнаруживаемой последовательностью.

На этой схеме протекания синим цветом отображен (условный) обнаруживаемый участок двухцепочечной ДНК, красным изображены два праймера - коротких одноцепочечных молекул ДНК. В реальных системах обычно обнаруживаемый участок ДНК, изображенный синим, в несколько раз длиннее.

Итак, для того, чтобы прошла реакция, нужно, чтобы оба праймера "нашли" свою комплементарную последовательность в результате теплового движения в пробирке. Исходя из этого мы можем понять, возможно ли сделать такие праймеры, которые находили бы комплементарные участки и в геноме вируса гриппа, и в геноме SARS-CoV-2? Для этого мы можем посмотреть напрямую на их геномы.

В качестве исследуемого генома вируса гриппа возьмем изолят A/California/07/2009(H1N1) (ссылка на геном), а в качестве генома коронавируса - изолят Wuhan-Hu-1 (аналогично, ссылка на геном)

Сформулируем задачу так - есть ли в этих геномах достаточно длинные одинаковые участки, чтобы на них можно было посадить праймеры? Я могу вам дать ответ на этот вопрос, формализовав его - какая максимальная длина общей подпоследовательности в этих геномах?

Ответ таков - в этих двух геномах есть всего лишь одна общая подпоследовательность TTATTATCTTTTGGTT (это если по двухцепочечной ДНК, в РНК тимину будет соответствовать урацил), она имеет длину 16 нуклеотидов и расположена у коронавируса в гене ORF7b, а у вируса гриппа - в гене нейраминидазы. Общих участков длиной 17 уже нет ни одного.

А для того, чтобы ПЦР успешно размножила участок ДНК, нужно, чтобы было два участка длиной 20, расположенных рядом в обоих геномах. Только в этом случае тест-система будет способна перепутать эти два вируса.

Но и это ещё не все. Современным тест-системам мало, чтобы подходили праймеры, нужно, чтобы совпадал ещё и третий участок - место посадки зонда.

Зонд (условный), используемый для ПЦР. На одном его конце расположена флуоресцентная группа, на другом - гаситель, отбирающий энергию у флуоресцентной группы и рассеивающий её в тепло. В ходе ПЦР эта молекула разделяется на части, в результате чего появляется свечение.

С учетом того, что в современных тест-системах должны совпадать уже три участка, расположенных рядом, даже разрешение на несовпадение одного-двух нуклеотидов в каждом уже ничего не дает.

Вывод: сделать ПЦР-систему, которая способна перепутать возбудителей гриппа и COVID-19, невозможно.