Сараи и амбары - это хозяйственные сооружения. Следовательно, технические решения по их эксплуатации должны быть в первую очередь экономичными.
Следовательно, думаю, что правильный ответ - так просто дешевле.
Второй возможный правильный ответ: красный цвет наиболее заметен на фоне синего, зелёного и других природных цветов. А фермы могут занимать площадь в сотни гектар. И видеть издалека куда ехать может быть просто удобно.
Возможно, со временем, это превратилось в стандарт, но явно не без практических причин.