Из вашего вопроса неясно, какое образование вы получили между школой и магистратурой. Если вы получили степень бакалавра, то при поступлении в очную магистратуру вам положена отсрочка, т.к. бакалавриат и магистратура считаются двумя ступенями одного высшего образования. Если же вы получили диплом специалиста, то отсрочки по закону нет. Специалитет - полноценное высшее образование, и поступление в магистратуру после него является получением второго высшего образования. Цитата из закона:
"Право на отсрочку от призыва на военную службу имеют граждане:
а) обучающиеся по очной форме обучения в:
....
образовательных организациях и научных организациях по имеющим государственную аккредитацию:
программам магистратуры, если они не имеют диплом специалиста или диплом магистра и поступили в указанные образовательные учреждения в год получения квалификации (степени) "бакалавр", - на время обучения, но не свыше нормативных сроков освоения основных образовательных программ". (Закон о воинской обязанности и военной службе, ст.24, п.2).