Астрофизикам и космологам вообще не нужна никакая начальная точка. Да у них даже система координат движущаяся (comoving coordinates).
Зависит от того какая цель у этого аппарата. Если это околоземный объект то это Земля. Если же это межпланетный, то если не ошибаюсь то солнце. Но второе не факт.