При повышении температуры скорость движения молекул увеличивается. В 8 кл. говорится, что чем выше скорость молекул, тем выше температура. Т. е. причинно-следственная связь совсем обратная. Как быть?

Потому что одно приводит к другому.
Повышение скорости молекул на молекулярном уровне("маленьком") приводит к повышению температуры чего-либо на физическом("видимом")уровне.
И наоборот:может повыситься сначала температура,а потом и скорость молекул.
(Тепло-энергия,а чем больше энергии,тем больше сама скорость.Теперь,я думаю,вам всё получиться объяснить.Для большей ясности:одно не мешает другому,и причинно-следственная связь тут не обратна,т.к. в 8 классе говорилось со стороны скорости молекул,а у вас тут со стороны температуры.Если скорость влияет на внутреннюю энергию,по сути переходящей в тепловую,то тепловая энергия влияет на скорость реакций,а значит и движение молекул.)