На данный вопрос можно ответить только вопросом. И вопрос этот такой:
РПЦ - религиозная структура (которая позиционирует себя как), носитель нравственных начал русского народа. И да, она обязана обращать внимание на случаи, которые являются (либо могут быть истолкованы как) нарушениями этой самой нравственности. Нарушение траура к таковым относится. Ибо, без обид, но это (любое развлекательное мероприятия в следующий день после такой трагедии) как минимум некрасиво - со светской точки зрения в том числе.
Кроме того, на данный момент причины авиакатастрофы не установлены. Кто должен волновать Нилова и Патриархию - непонятно.
Ну и дополнительное
Потому что мы живем в "государстве наоборот". Потому что у нас не государство для человека, а человек для государства. То же и с религиозными объединениями, которые являются органическим продолжением этого государства.