Интонация вопросительного предложения относится к самой цитате и вносится вовнутрь, а точка же означает конец предложения, а саму цитату(или её фрагмент) нельзя окончить точкой, так как это, по сути, та же прямая речь, правила те же примерно.
полагаю, что предложения повествовательные, не теряют смысла при переносе точки за кавычки. а вот вопросительные предложения будут смотреться иначе, если знак перенести за кавычки и могут вовсе не показаться вопросительными.