Если мы говорим об окаменелостях живого происхождения, то в этом случае их тела разлагались, одновременно кристаллизуясь из-за замещения органики неорганикой. Подобный механизм называется "фоссилизация" и он происходит под воздействием окружающей среды.
Бывает и так, что сохраняется сам биологический материал, в данном случае происходит своеобразная консервация, например, так появляются замёрзшие во льдах мамонты и т.д
Я не биолог, но надеюсь, что какое то краткое определение я вам дал.
"Откуда взялась земля, которая погребла под собой археологические находки?"
"Знаете, органика заменилась на неорганику..."
Не моя тема, но человек разбирается в вопросе. Я не нашел косяков в логике, даже с моими погаными познаниями в геофизике.
Откуда взялась- переместилась из другого места, ветром надуло например. Нужно понимать, что все эти находки и сохранились потому что их засыпало, а вот большую часть, та что не законсервировалась землей, утратилась.