Во время тренировки процессы пищеварения замедляются, но не думаю что это приведёт к каким-либо серьёзным негативным последствиям. Если чувствуете себя нормально и обед "не просится обратно", то в целом можно тренироваться, хоть, желательно, не слишком интенсивно.
Но рекомендуется давать промежуток в 1-2 часа (зависит от объёма пищи), если вариантов никаких, то увеличьте калорийность завтрака, снизив калорийность обеда. Плюс в обед можно подобрать продукты с более высокой калорийной плотностью, то есть больше энергии в меньшем объёме (таблицы можно найти в гугле).