Добрый день
Посмотрите раздел "Мои налоги". Если сумма все еще "висит" в ЛКН и кнопка "Распорядиться переплатой" активна, подавайте жалобу на бездействие сотрудников ФНС. В жалобе описываете сроки, когда Вы подавали заявление на возврат и в какие сроки деньги должны были вернуться. В течение месяца ФНС обязаны отреагировать на Вашу жалобу.
Если же денег в ЛКН нет, значит Казначейство перечислило их. Проверяйте счет, указанный в заявлении. На практике была ситуация, когда указали реквизиты заблокированной карты и, чтобы снять деньги, пришлось идти в банк.