Для большей формальности введём критерии сложности.
-отношение загруженности курса к количеству часов лекционных и семинарских занятий
-общее впечатление множества изучавших
-необходимая начальная подготовка для осваивания предмета
Дальше я судить могу лишь из своего опыта, например на мат. анализ в МФТИ выделяется куча времени и он довольно легок в освоении. На моем факультете есть предмет, от которого страдает много народу - стохастические процессы, но он тоже не особо сложен, так как не требует обширных знаний. Поэтому я считаю самым сложным предметом в МФТИ(!) функциональный анализ, из-за его высокой требовательности к начальным знаниям и малого времени его изучения.
Я гуманитарий, но слышал, что среди студентов технических специальностей, самые большие сложности вызывает сопромат. Даже существует поговорка, что, сдав его, можно жениться.
Для меня - математический анализ. Я люблю математику, но в матане столько абстрактных вещей, оторванных от понятной мне реальности. А то, что я не могу осознать, - я не могу выучить и запомнить.