Все зависит от того для чего он будет использоваться.
В корпоративной среде очень популярны дистрибутивы на базе Red Hat Enterprise Linux - RHEL, CentOS, Fedora. В Европе популярен Suse Linux и Open Suse. Отнесем сюда также Debian
Для персонального использования неплохим выбором могут быть Ubuntu, Linux Mint, Arch Linux
Есть более узкоспециализированные дистрибутивы: для проверки безопасности (и взлома :) Kali Linux
Для создания образов Docker - Alpine Linux
Для роутеров, wifi точек доступа - OpenWRT
Однозначного ответа на этот вопрос нет, попробовав много разных дистрибутивов, я для себя выбрал Линукс Минт с XFCE и радуюсь удобству и быстрой настройкой и кучей хелпов в сети почти по всем возникающим проблемам