Сделайте корректирующую декларацию, в справке 2-НДФЛ будет видна сумма, которую нужно указать , как уже полученную, указать код вычета 311
Код вычета 311 в справке 2-НДФЛ говорит о том, что плательщик подоходного налога воспользовался своим правом на имущественный вычет.