Дезинфицируют ли священники «ложицы» как-то перед причастием людей? И что если среди причащающихся будут люди с заболеваниями, что могут так передаваться?

К сожалению нет.
В детстве довольно часто ходил в церковь и ни о каких, даже самых элементарных правилах гигиены там не слышали. Меня всегда смущало то, что я должен целовать крест, после того, как его поцеловало с полсотни людей. Когда я сказал матери, что боюсь заразиться какой-нибудь болезнью, то она ответила, что всё освящено и покрыто слоем серебра, потому, инфекции не липнут к ритуальным приборам.