Да, можно.
Вычет по стоимости самой квартиры и вычет по ипотечным процентам - это два разных вычета. Которые могут быть не связаны между собой.
Если ранее вы не получали вычет с процентов, то вы вправе это сделать сейчас. Тот факт, что по новой квартире вы вычет не заявляете (только по процентам) никакого значения не имеет.
В вычет включите всю сумму процентов по ипотеке, которую вы фактически заплатили банку с момента получения кредита по 31 декабря (включительно) того года, в котором вы заявляете вычет.
К декларации приложите копию кредитного договора и справку банка об уплаченных процентах.