Конечно можете, проблем не будет!
При поступлении будут смотреть результаты только тех предметов которые необходимы для поступления на специализацию "Стоматолог" а так как физика к этим предметам не относится, проверять и смотреть результаты по ней никто не будет, не переживайте и готовьтесь к химии.
Желаю успехов при поступлении!