Здравствуйте.Главное условие для предоставления Отсрочки от армии по обучению-это поступление на магистратуру в год окончания бакалавриата.
В законе нет запрета на смену образовательной организации, в год окончания бакалавриата.
Важно: поступить в аккредитованный Вуз, на очную форму обучения, тогда право на предоставление отсрочки вы сохраните на период обучения на магистратуре.