Здравствуйте.Зачастую справку по форме №2, необходимую для оформления отсрочки по обучению, выдают гражданину на руки ( однако, ее действительно может отправить и учебное учреждение)
Но, для оформления отсрочки необходимо пройти ещё заседание призывной комиссии.
Если военкомат не получил справку вовремя, для начала предупредите сам военный комиссариат, что возникла такая ситуация и Вероятнее всего военкомат пойдёт вам на встречу в вашем вопросе.
Так как вы не воспользовались своим правом на отсрочку.
Если же призывная комиссия проигнорирует данный факт, вы можете обжаловать решение военкомата.