Здравствуйте.Вы должны встать на воинский учёт в военный комиссариат в г.Москва.
Затем, если вы не имеете оформленной отсрочки от армии по обучению, можете пройти медицинскую комиссию.
Или предоставить справку об обучении и вам будет предоставлена отсрочка на весь период обучения в учебном учреждении.
Поэтому, да можете пройти медицинскую комиссию, но подготовьте все подтверждающие медицинские документы ( если имеются не призывные заболевания)