Добрый день. В данном случае сотрудники военного комиссариата поступают незаконно. Рекомендую подать сопроводительное письмо с перечислением имеющихся у Вас медицинский документов, которые Вы хотели приобщить к личному делу.
Подавать сопроводительное письмо рекомендую в двух экземплярах, один экземпляр Вам возвращают с пометкой о принятии. Этот экземпляр будет являться доказательством того, что данные документы приобщены к личному делу.