Живем с парнем вместе в его квартире, с нами изначально живут его друзья (тоже пара), как справиться с нарастающим ощущением дискомфорта от проживания с ними?

Только решением об отдельном проживании.
Какими бы распрекрасными не были друзья - это отдельные люди, живущие свою отдельную жизнь. Но делающие это при этом - в вашем личном пространстве. Какими то полумерами, компромиссами этот вопрос решен не будет. Всегда будет вторжение чужой жизни в ваш микроклимат и вызванный этим дискомфорт. Притом, еще раз подчеркну, они могут быть вполне себе замечательными людьми. Дискомфорт именно от факта вторжения в личное пространство.