Ну, во-первых, нужно выбрать университет, где собираетесь учиться и на каком языке. Приехать туда, посмотреть что да как, хотя бы на пару дней. Некоторые университеты не выкладывают пробные варианты экзаменов к себе на сайт, поэтому нужно будет найти людей, у которых есть прошлогодние варианты. Также нужно будет пройти процедуру нострификации. Это когда ваш диплом бакалавра подтверждают в Чехии. Этим лучше заняться заранее, поскольку процедура может длиться пару месяцев, а без этого вас никуда не возьмут.
Это я писала про гос.университеты.
Если хотите учиться в частном, то просто готовьте денежки.