Яндекс Go может оказать помощь в регистрации, но регистрироваться плательщиком НПД или нет решать Вам. Регистрация проходит через приложение мой налог с любого мобильного устройства за 5 минут.
Сегодня более выгодно сотрудничать с Яндекс Go как ИП, но при этом иметь статус самозанятого гражданина, то есть быть и ИП и СЗ.
При такой комбинации у Вас есть выбор отчислять средства в ПФР на свою пенсию или нет. Если Вам это не нужно, подавать заявление о прекращении применения УСН и будете ИП с системой налогообложения НПД без ежегодных отчислений в ПФР.
Им невыгодно работать с самозанятыми. Поэтому придумывают вполне законные отмазки: приложение не правильно функционирует и так далее. Так что можете зарегистрироваться в другом таксопарке и также работать на яндекс. Им так выгоднее)