Можно, только если комната в общежитии выделена в собственность. Не просто в собственности ( это само собой должно быть обязательно), а площадь ее "выделена" и оформлена должным образом в собственность. Тогда комната подходит и под ипотеку, и под маткапитал.
Узнать выделена она или нет: можно это увидеть в документах на квартиру.
С уважением к Вам, Елена.