Здравствуйте, при расчете налоговой базы вы можете воспользоваться одним из двух способов:
1) Доход - расход. При наличии документов, подтверждающих покупку квартиры за 1 600 000 рублей, вы можете применить этот вид вычета. Тогда сумма налога будет (2 000 000 - 1 600 000)*13% = 52 000 рублей.
2) Доход - 1 млн. рублей - это фиксированная сумма вычета.
Сумма налога в этом случае будет: (2 000 000 - 1 000 000)*13%=130 000 рублей.
Вы можете выбрать любой из этих способов.